tarama diğeri ise daha derin bir şekilde tarama yapar ve daha çok zaman alır; ancak daha güvenilirdir. Buna ek olarak, hafıza koruma modülü de potansiyel tehlike barındıran işlemlerden kaçınır ve şüpheli öğeleri incelemek için karantina listesi oluşturur.
Tüm bunlardan ayrı olarak, Malwarebytes uygulaması File-Assassin (Windows tarafından engellenen dosyaları ortadan kaldırmak) gibi birkaç küçük seçeneğe de sahiptir. Bu özellik, kötü yazılımdan kurtulmada uygulamanın ne kadar faydalı olduğunu kanıtlar.