eferinde aynı tarzın üç ya da daha fazla Pokemon'u eşleştirmek için birini hareket ettirebilirsiniz. Birleştirdiğinizde ise Pokemon kaybolur ve düşmanınıza hasar verirsiniz.
Oyunun, oyun kurgusu içinde ilgi çekici yönleri mevcut. Örneğin, bir ateş Pokemon'una karşı oynuyorsanız (mesela Charizard), su Pokemon'uyla savaşmak ilginçtir, çünkü oyun tahtasında onları birleştirmek düşmana çok fazla hasar verir. Ayrıca, Pokemon'unuzun seviyesini yükseltebilirsiniz, bu da karakterinizi daha güçlü bir rakip yapar.
Pokémon Shuffle yaklaşımında çok orijinal bir oyun değil, ancak Pokemon dünyasını Match 3 türüne başarılı bir şekilde tanıttı. Grafikleri ise büyüleyicidir (olması gerektiği gibi) ve tüm detaylar güzel bir şekilde oluşturulmuştur.